RNA提取技术服务 赛尔生物(天津)
RNA提取技术服务 赛尔生物(天津)
RNA是生命活动中基因表达过程非常重要的生物大分子,如mRNA,它携带了DNA的全部编码信息。RNA的分离是研究基因功能的重要基础之一,在分子生物学中占有重要的地位。提取的mRNA可用于Northern blot、RT-PCR、构建 cDNA文库、Gene Chips以及体外翻译等实验,在动物细胞内,所含RNA主要是 rRNA(占80~85%)、tRNA及小分子RNA(占10~15%)和 mRNA(占1~5%)。rRNA含量最丰富,由28S、18S和5S几类组成。mRNA种类繁多,分子量从数百至数千碱基不等,但绝大多数mRNA在3’端都有一个Poly-A尾巴,因此,可根据此特性用寡聚脱氧胸苷(Oligo dT)层析柱从总RNA中将 mRNA分离出来。
TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。
一、 组织和细胞总RNA提取:
异硫氰酸胍法
(一)试剂准备
1.CSB缓冲液:42mM柠檬酸钠;0.83% N-lauryl sarcosine(十二烷基,N甲基甘氨酸钠);0.2 mM β-巯基乙醇。
2.变性液:异硫氰酸胍(终浓度 4 M)25g、CSB缓冲液 33ml,混合直至完全溶解,可在65℃助溶。4℃保存备用。
3.2 M乙酸钠:pH 4.0。
4.异丙醇
5.无水乙醇、70%乙醇
6.酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)
7.0.1%DEPC H2O:(因DEPC难溶 先取1ml DEPC溶液于2ml 95%的乙醇中)再加到1000ml ddH2O中,弃分振荡,37℃孵育过夜,15磅高压灭茵,4℃保存备用。
(二)操作步骤
1.样品处理:
(1)培养细胞:收集细胞1-2×107,离心,500g×5min。对于贴壁培养细胞,用0.25%胰蛋白酶-EDTA消化后,PBS重悬细胞并转移至10ml离心管中;悬浮培养细胞可直接转移离心管;离心:500g×5min;PBS洗涤3次。弃上清,置冰浴。加预冷变性液2 ml,充分摇动,使细胞裂解完全。以下操作均在冰浴中进行。
(2)组织:取1-2g组织(新鲜或-80℃及液氮中保存的组织均可)置组织匀浆器中,加入预冷的变性液12ml,在冰浴中充分匀浆。
2.加2 M乙酸钠(pH 4.0)0.2ml,混合后将溶液转移至5ml离心管中。
3.加酚:氯仿:异戊醇2.2ml,颠倒混合用力振荡10s,冰上放置10min。
4.4℃离心,12000g×20min。
5.小心吸取上层含有RNA的水相,并转移至一新的5ml离心管中。避免吸取两相之间的蛋白物质。
6.加等体积的异丙醇,置-20℃至少30min,沉淀RNA。
7.4℃离心,12000g×15min。
8.弃上清,再加变性液2ml重悬RNA沉淀物,振荡直至RNA完全溶解(必要时可65℃ 水浴促溶)。
9. 加入等体积异丙醇,置-20℃ 30min。
10. 4℃离心,12000g×15min。
11. 弃上清,加入70%乙醇4ml洗涤RNA沉淀。4℃离心,8000g×5min。
12. 弃上清,将沉淀晾干。
13. 加入适量DEPC H2O溶液解RNA(65℃促溶10-15min)。
(三)注意事项:
1.所有实验过程均须避免Rnase的污染。
2.要避免沉淀完全干燥,否则RNA难以溶解。
TRIzol法
TRIzol RNA提取试剂盒是由GIBCO BRL公司推出提取RNA的产品,其操作方便、快捷。
(一)试剂准备
1.TRIzol试剂。
2.氯仿
3.异丙醇
4.75%乙醇(DEPC H2O配制)
5.DEPC H2O
(二)操作步骤
1. 样品处理:
1 培养细胞:收获细胞1-5×107,移入1.5ml离心管中,加入1ml Trizol,混匀,
室温静置5min。
2 组织:取50-100mg组织(新鲜或-80℃及液氮中保存的组织均可)置1.5ml离心管 中,加入1ml Trizol充分匀浆,室温静置5min。
3 加入0.2ml氯仿,振荡15s,静置2min。
4 4℃离心,12000g×15min,取上清。
5 加入0.5ml异丙醇,将管中液体轻轻混匀,室温静置10min。
6 4℃离心,12000g×10min,弃上清。
7 加入1ml 75%乙醇,轻轻洗涤沉淀。4℃,7500g×5min,弃上清。
8 晾干,加入适量的DEPC H2O溶解(65℃促溶10-15min)。
(三)注意事项
1. 样品量和Trizol的加入量一定要按步骤(1)的比例,不能随意增加样品量或减少Trizol量,否则会使内源性RNase的抑制不完全,导致RNA降解。
2. 实验过程必须严格防止RNsae的污染。
Trizol法提取冻存组织总RNA protocol(05-11-23)
1 于—80℃取出组织,秤重,放入盛有液氮的保温杯中。
2 将组织放入研钵,倒入少量液氮,研磨至细粉状,其间不断加入液氮。
3 按每100mg组织加入1mlTrizol,此时Trizol呈固态,继续研磨,固态变为透亮的液态,液体转移至1.5 EP中,每管1ml, 冰上静置5min。
4 每管加入200ul -20℃预冷的氯仿,混匀,冰上静置10min。
5 4℃ top speed 20min.
6 转移上清至新管,每管加入1-2VL -20℃预冷的异丙醇(或1-4V -20℃预冷的乙醇),混匀,-20℃静置 ﹥2h。
7 4℃ top speed 30min.
8 弃上清,每管加入1ml 70%或75%酒精,弹起沉淀,4℃ top speed 10min。
9 重复8
10 弃上清,室温晾干,用DEPC-treated的水溶解,
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