在大棚建造时，棚与棚之间要留出一定的距离，两棚之间空地的正确距离以4—5米为宜，在棚前脸处挖一条与大棚同长的排水沟，排水沟宽约半米，深约30厘米左右，好让大棚面上留下的水随时流走，防止积水过多流入棚内。同时，这样在冬季既不互相遮阴，又可排雪排水，作用明显。在棚区建设时，要有规划好的防洪沟或其他沟渠，遭遇强降水时可及时将积水排出。
进入夏季以后，降雨增多，暴雨更是说来就来，如果温室大棚预防措施不到位，便会出现排水不及时，造成雨水倒灌，种植作物减产甚至大棚坍塌等一系列的问题。从前短时间南方暴雨洪涝灾害的惨痛场面就能看出，这样的天气对于农场的毁灭性有多大，因此，做好温室大棚的夏季防雨防涝的措施尤为重要。
夏季遇到较强降雨的时候，温室大棚表面上的降水会流到棚前侧，如果碰到地势较低，又无排水渠排水，会导致严重积水，后果严重时可能会引起积水倒灌进温室大棚，把温室大棚前脸泡垮，直接引起种植作物的损失，严重情况可能会使温室大棚墙体倒塌。之前全国各地出现多次因为强降雨引发雨水倒灌，排水不畅，导致温室大棚垮塌的事件，需要引起格外的重视。
温室大棚开窗、通风、降温系统：温室通风是温室内部空气与室外空气进行交换的过程，以调控温室内温度、湿度、CO2和排除有害气体为目的，达到满足室内栽培植物正常生长要求的需要。温室通风在温室设计中占据重要位置，是温室生产环境调控必须采取的措施。现代连栋温室通风方式有两种：自然通风和风机通风。
连栋温室的自然通风主要依靠开窗系统。开窗系统是指在温室大棚中使用电力或人力，通过开窗传动机构将温室顶窗或侧窗开启和关闭的设备系统。现代连栋温室中常用的开窗系统，是依靠电力驱动的齿轮齿条开窗系统和卷膜器开窗系统。
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