通常，市场上出售的袋装牛奶就是采用巴氏灭菌法生产的。工厂采来鲜牛奶，先进行低温处理，然后用巴氏消毒法进行灭菌。用这种方法生产的袋装牛奶通常可以保存较长时间。当然，具体的处理过程和工艺要复杂的多，不过总体原则就是这样。需要指出的是，喝新鲜牛奶（指刚刚挤出的牛奶）反而是不安全的，因为它可能包含对我们身体有害的细菌。
诸城市利特食品机械有限公司生产的巴氏杀菌机是集中热交换供给系统的主体机型，并可以充分显示出巴氏杀菌单位控制的优异性能———所有的理论指标在这里均已达到。只有在没有其他可能性的情况下，才使用溢流系统中的净水，这样，与传统的巴氏杀菌机相比较，就可以减少35%～40%的用水量。经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢。
当今使用的巴氏杀菌程序种类繁多。“低温长时间”(LTLT)处理是一个间歇过程，如今只被小型乳品厂用来生产一些奶酪制品。“高温短时间”(HTST)处理是一个“流动”过程，通常在板式热交换器中进行，如今被广泛应用于饮用牛奶的生产。通过该方式获得的产品不是无菌的，即仍含有微生物，且在储存和处理的过程中需要冷藏。“快速巴氏杀菌”主要应用于生产酸奶乳制品。
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