一是政策掌握不到位会计代理，核算不准确会计代理。税收新政对涉税业务处理等提出了新要求。由于营业税是对营业额直接征税会计代理，核算模式简单易懂。而增值税采用进项抵扣的核算模式，核算难度较原来大幅增加。而且，“营改增”不仅改变了企业的整个涉税核算体系会计代理，同时还带来了开票系统、报税系统、认证抵扣、税款缴纳等操作方面的一系列新问题会计代理，营业税背景下的简易核算模式已远远不能适应增值税政策的相关要求，涉税业务处理稍有不慎便会产生税收风险。由于税收政策受经济发展变化的影响较大会计代理，若是企业未能及时调整纳税行为，则很容易使原本合法的纳税行为变成违法行为。 二是信息不对称会计代理。税务机关有强大的政策信息来源和信息采集、比对系统。尤其是与第三方数据衔接后，税务机关可以掌握企业的所有涉税信息。而纳税人信息来源渠道窄，获取信息质量差，信息时效存在一定的滞后性，与税务机关相比存在一定的劣势。
三是自我保护能力差。大部分企业对于如何防范风险、如何进行税收风险流程管控等缺乏应有的了解。既没有事先控制的相关手段和方法，也不知道事中应对的技巧，更不明了事后完善的重要性，只能被动的应对税务稽查。
四是对税务机关的工作思路和方式缺乏最基本的了解。相对于税务机关对企业信息的掌握程度而言，企业对税务机关的了解基本为零。对于税务稽查的近期关注重点、检查项目、工作思路及方法都缺乏必要的了解，无法做到主动应对、主动化解相关风险。
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