潜水搅拌机主要应用于市政、工业和城镇居民生活污水处理过程中的混合、搅拌和环流，如活性污泥池、生物反应池、搅拌池、贮泥井、均衡池、污水池等;景观水环境的养护设备，创建水流;增加水中含氧量，改善水体质量;有效阻止悬浮物沉积等场合。
潜水搅拌机在污水处理工程中的应用主要有以下四个方面:
(1) 潜水搅拌机进行水力循环。
在厌氧池、缺氧池和氧化沟等池中只需提供必要的循环流速就可以保持池内的混合液呈悬浮状态，使微生物与基质充分接触，通过搅拌器输入的能量，形成连续循环水流，这种设计不仅能有效地保持混合液悬浮，而且由于池内循环水流的流量通常高于进水流量数十倍甚至上百倍，使池内水流产生了巨大的稀释均化能力，因而这种反应器具有耐受冲击负荷的优良工艺特性。
(2) 潜水搅拌机提高传氧效率。
曝气是维持好氧微生物正常代谢的基本手段，水下曝气系统的传氧效率又与水深有着直接的关系。在曝气池中采用潜水搅拌机将曝气池设计成上述连续循环流池型，就会在循环流速的作用下，改变由曝气头释放“气泡”的路径，增大“传氧水深”，提高传氧效率。采用这种设计通常可使曝气系统的传氧效率提高15%左右，污水处理的能耗与运行费用也随之节省。
(3) 潜水搅拌机方便分格、分段处理。
当单格池容积较小时，可将每格设计成正方形平面或圆形平面，并在每格中设置一台 污水处理搅拌机。
(4) 潜水搅拌机改善水体水质。
在许多受到污染的水体和污水处理所用的深度处理塘中，往往会遇到水深较大、水流滞缓、水体表面复氧不能保证深水区溶氧要求等情况、可以设置搅拌机进行人工呼吸”为深水区复氧，改善整个水体的水质。这种人工呼吸”技术是一种简单有效的水质改善手段。
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