按安装方式分为：内置式、外置式两种。
内置式：内置式水箱自洁消毒器多为臭氧型，该设备主要有两部分组成，一部分为主机即臭氧发生装置，另一部分为辅机即臭氧与水高效混合装置，主机一般都固定到水箱、水池一旁，辅机固定到水箱、水池内部，主机与辅机之间通过电缆和输气管相连接。
外置式：外置式水箱自洁消毒器安装在水箱外部，设备有2-3个口即（进水口、出水口、排污口多为：20，25,32,40,50），该设备有臭氧型、微电解型。水通过进水口消毒后的水经回水管流到水箱内部；
水箱臭氧自洁消毒器原理的工作原理是氧气（或空气）通过高频高压电场，使氧转化为臭氧，并及时与水混合，利用臭氧的强氧化作用，杀灭水中的细菌。杀灭细菌效果最佳浓度，可以通过改变进水压力、气量、电流等调节来达到。
由于臭氧在水中的氧化还原电位为2.07v，比氯（1.36v）高，所以在臭氧量仅为氯的万分之一时，灭菌效果比氯及其它药剂快600-3000倍，数秒内可杀死细菌
首先将自洁消毒器的循环水缸置于水箱的中下部，以保证水箱的水循环均匀。当水位达到液位计设定的高水位时，电控柜开始启动高压电源和潜水泵所产生的强氧化气体经管路，至曝气部分；对水进行曝气消毒，同时，潜水泵将经过消毒的水送回水箱，使停滞的水循环起来，如此循环下去，对水彻底的消毒，保证了水的质量
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