中央空调能保证向房间输送新风，使房间始终保持空气清新、卫生。但分体空调无法送入新风，故难以确保空调房间空气的新鲜度;而如果通过开门、窗通风换气，则冷量就会大量损失，这不仅影响房间温度，而且浪费了能源。
中央空调投资低于分体空调。如制冷量1160kw中央空调的制冷空调设备总投资约为380万元，而同等冷量的分体空调的投资费为400台*10000元/台=400万元。如中央空调的制冷站土建费粗估为10万元，则中央空调的土建与设备总投资为390万元;如分体空调粗估冬季供暖设备费为40万元，则分体空调实现夏供冷、冬供热的设备总投资为440万元，可见中央空调投资费仍低于分体空调加供热系统的投资费。
中央空调的空调效果优于分体空调。中央空调可做到均有管道式空调送回风口或风机盘管送回风口。现以总制冷量1160kw工程为例;中央空调可使每个房间(诸如餐厅、宴会厅、多功能厅、写字间、客房、门厅、康乐中心各房间、办公室、ktv歌舞厅、声光控制室和卫生间等)均实现夏季供冷、冬季供暖和春秋季通风换气的全年性空调效果。
如要达到与中央空调同等冷量的效果，分体空调方案则须购置11.6kw(1×104kcal/h)分体空调机100台，或购置2.9kw(0.25×104kcal/h)分体空调机400台，采用分体空调只能夏季供冷，而冬季供暖则须另外设置供暖系统。即使这样也难确保每个房间均能装上分体空调机，因分体空调机的室内机与室外机的连管一般为3m长，最长为5m，有些房间由于条件所限，室内外机安装距离难以确保小于5m，如大于5m分体空调机的效果就不是很好了。
中央空调寿命长。分体空调如为公用，一般3～5年就须换新机，而中央空调设备则可用8～15年。
中央空调噪声小于分体空调。中央空调可加装各种消声装置降低噪声，而分体空调如采用窗式空调器，则难以实现降噪措施。
中央空调可与装修施工密切配合实现高雅、豪华之效果。中央空调管路和设备均可隐蔽在吊顶内，使不同功能的房间的装修做到各种造型的布局，实现现代建筑装修的特殊效果，给人以高雅、豪华、明快、舒适之美感。但分体空调的风冷式室外机须零散的悬挂在外墙上或装于室外地面上，影响外装修效果，而室内机则须挂在内墙上或安放在地面，又占用了室内空间，这无形中减小了房间的使用面积。
分体空调的凝结水不易处理好。
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