中央空调运行管理灵活方便，且运行费用低于分体空调。中央空调制冷站可直接控制制冷机的开停时间和冷量大小，可根据气候变化进行调整，以节约运行电费。而分体空调如制冷量大于58kw时，其运行电费就大于中央空调，而且难以进行各分散房间的统一控制。
中央空调故障少好维修。中央空调无论是空调机组和送回风道系统，还是房间风机盘管和新风系统，均不易发生故障，而制冷设备则设在制冷站内，便于维修。但分体空调的分体空调器遍布在各处，制冷压缩机不仅数量多而且多数悬挂于外墙上，出了故障很难一一去维修好。
中央空调能保证向房间输送新风，使房间始终保持空气清新、卫生。但分体空调无法送入新风，故难以确保空调房间空气的新鲜度;而如果通过开门、窗通风换气，则冷量就会大量损失，这不仅影响房间温度，而且浪费了能源。
中央空调投资低于分体空调。如制冷量1160kw中央空调的制冷空调设备总投资约为380万元，而同等冷量的分体空调的投资费为400台*10000元/台=400万元。如中央空调的制冷站土建费粗估为10万元，则中央空调的土建与设备总投资为390万元;如分体空调粗估冬季供暖设备费为40万元，则分体空调实现夏供冷、冬供热的设备总投资为440万元，可见中央空调投资费仍低于分体空调加供热系统的投资费。
中央空调的空调效果优于分体空调。中央空调可做到均有管道式空调送回风口或风机盘管送回风口。现以总制冷量1160kw工程为例;中央空调可使每个房间(诸如餐厅、宴会厅、多功能厅、写字间、客房、门厅、康乐中心各房间、办公室、ktv歌舞厅、声光控制室和卫生间等)均实现夏季供冷、冬季供暖和春秋季通风换气的全年性空调效果。
如要达到与中央空调同等冷量的效果，分体空调方案则须购置11.6kw(1×104kcal/h)分体空调机100台，或购置2.9kw(0.25×104kcal/h)分体空调机400台，采用分体空调只能夏季供冷，而冬季供暖则须另外设置供暖系统。即使这样也难确保每个房间均能装上分体空调机，因分体空调机的室内机与室外机的连管一般为3m长，最长为5m，有些房间由于条件所限，室内外机安装距离难以确保小于5m，如大于5m分体空调机的效果就不是很好了。
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