大日如来系密宗将宇宙实相佛格化之根本佛，亦为一切诸佛菩萨所出之本原及所归之果体;其身口意业遍虚空，演说如来之三密门金刚一乘甚深教。大日经疏卷一谓，大日如来分本地法身与加持受用身两种，其中，本地法身指如来之自证极位，加持受用身指说法之教主;彼以平等之身口意秘密加持为所入之门(即以身平等之密印、语平等之真言、心平等之妙观为方便)，故知加持受用之身即是毗卢遮那遍一切身，此二身毕竟无二无别。故密宗以大日如来为高之佛格与根本总德。以其与诸法遍在，故密号遍照金刚。
又因大日如来为金、胎两部曼荼罗之主尊，故非常被重视，其智德以金刚界大日如来表示之，其理德则以胎藏界大日如来表示;理、智虽然二分，实际亦不相离。金刚界大日为金刚界九会中，除理趣会以外之中尊，位于五佛中央，现菩萨形，身呈白色，戴五智宝冠，结智拳印，结跏趺坐于七狮子座，此即智法身，种子为徤(vam!)，三昧耶形为率都婆;胎藏界。
大日则为位于中台八叶院中央之理法身，亦现菩萨形，身呈黄金色，头戴五佛宝冠，结法界定印，坐于八叶莲华台上，种子为"阿"(a)，三昧耶形为窣都婆或如来顶印。
现存之大日如来像，不论绘画或雕刻，均为坐像，没有立像或倚像，且其雕刻材料几乎限用木材，此乃依此佛之性质而定。又天台宗每将释迦佛与大日如来之法身、应身视为同体，日本东密则将两者视为别体。
金刚界曼荼罗和胎藏界曼荼罗都以大日如来为主尊，但大日如来的形像和姿态在这两部曼荼罗中略有不同。
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