2015/9/7 12:14:08 来源： 上海通蔚实业有限公司
全基因组范围的代谢网络在基因组序列的基础上，结合基因功能注释信息，把基因编码蛋白所催化的生化反应构建为一个代谢网络，反应了基因-蛋白质-生化反应之间的相互作用，从而有效地转化为数学模型在计算机上进行模拟、分析，并用实验数据加以验证，提出假设。
这种网络能从全局的角度探索和揭示生物代谢机制提供一个有效的框架，很好地将基因型与表型的关系定量地关联起来。目前科学家们已经构建了包括真菌、古生菌和真核生物在内的多种代谢网络。
而要进行这种构建，COBRA是一种重要的方法，这种方法是由一系列针对基于约束的构建和模拟用途而编写的函数组成，含有可以读取SBML或Excel格式的模型的函数，使用者不再需要自己编写提取矩阵的程序。
此前研究人员就利用这种方法，对大肠杆菌E. coli的1,366个基因进行了计算机建模，该代谢模型包含了蛋白质的三维结构数据，能够预测特定细菌蛋白对温度的敏感程度
898995850
