不正当竞争案件赔偿额判定困难。在传统的不正当竞争案件中，法官将被告挤占的原告市场份额作为原告的损失，以原告损失作为赔偿额的计算标准，使用的是“填平原则”。互联网商业模式有不同于传统行业的收入模式，对其财产损失的认定与实体经济应有较大的不同。同时，互联网是双边市场，企业商誉和商品信誉的损害对其有重要影响，但是目前对于商誉诋毁所造成的品牌损失如何认定，在资产评估界和法律界都是一个难题。
随着‘云计算’技术的发展，互联网服务商可以分时间、分地域地给客户端发送指令，对他人软件造成干扰，给被侵权人的取证造成极大困扰。
互联网不正当竞争行为在短时间内可以造成巨大的损害后果，一天就可能造成几十万元的损失。同时，在互联网环境下，企业之间的商誉诋毁造成的恶劣影响快速传播，并经过较长的时间才能逐渐消除，而商业诋毁所造成的严重后果并不会随着软件的召回或者原告对软件的升级而终止。
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