（三）生物工程卫生间即由木屑和菌的作用分解粪便。
请天津科技大学的庞金钊教授介绍有关构造
（四）、臭水沟部分
在世界各地埋设下水道工程都是不容易的，因为经费有限，所以须有其他的新系统。下水道的排水因为处理消耗氧气的有机物将他流入河川的话，河川中的细菌会吞噬有机物一起消耗氧气。没有氧气的水，为全黑色，有如阴沟一般变成恶臭的水。
（五）场地设置
生物工程卫生间维持粪便水分量与蒸发水分量的平衡，其水分量若维持一致，木屑可以一直保持松软状态。为了保持卫生间的清洁，并且为了便于维护，对设置场所的使用人数有所估算，事先必须决定男性用大、男性用小或是女性用便器的数目。超过其处理能力的标准使用时，木屑会发黏，处理上会变的比较困难，推荐您选择稍有容纳空间的机种。设置生物卫生间的地方应整理场地，请进行地面的强化施工以使地面能承受本体的重量，如果地面不够坚固有可能会倾斜的话，请进行设置场所得地面基础施工。
（六）木屑的分量
请勿加入过量的木屑，过多过少的都将无法适当的处理分解，放入的木屑以盖住搅拌器的80%的程度为限，如果看到搅拌器的芯表示木屑太少则处理能力变弱，也不要放入过多的木屑，如果将搅拌器全部盖住，会引起搅拌不良和带来臭味。
（七）木屑和菌的交换
在标准的使用状态下，木屑和菌的交换时间为一年两三次，木屑变硬和搅拌器一起回转，回转时会产生断断续续的杂音，那是因为水分过多的原因，根据使用状态的不同，交换时间会有些变化，当木屑和搅拌器一起回转的情况出现时，就是应该交换了，当卫生纸总是无法分解含留在木屑中时表示水分不足，为了不让木屑太干，请关掉加热器，另外两个星期以上不适用时请关闭电源，长时间不使用而未关闭加热器，虽然不会引发火灾，不过可能有炭化发火的可能。
（八）木屑的定期检查
请每个月检查一次生物卫生间中的木屑，当卫生间混入异物请马上取出来，木屑太干燥时请关闭加热器开关，木屑太过潮湿时请交换木屑，潮湿的频率太高时请增加卫生间台数或换成大型的机种。
（九）卫生管理
卫生间的管理人，请提醒一天至少需清扫一次，地板等处有尿液附着，是发生恶臭的原因。另外，若有异物混入等情况应及早发现，请尽量避免使用化学洗剂。
（十）生物卫生间的使用方法
卫生纸以外的纸张即不易分解的纸张如生理用品湿纸巾等请勿投入便池内，另外，为了防止发生火灾，绝不允许将烟头投入便池内，大便完后，务必按下“运行”按钮，排泄物和卫生纸将一起消失在木屑中，保持卫生间的环境如果弄脏请您自觉打扫干净使下一位使用者也能有一个好的心情来使用。
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