杀菌锅的有些系统在杀菌和冷却过程中使用过压，以保持容器的完整性和平衡抵消罐内的压力。这样做是必要的，因为有些包装容器对内部压力的忍受力有限。过压杀菌容器的某些实例还有带热封盖的或双金属接缝罐端的半刚性塑料容器、软包袋袋、金属盘、纸板容器和玻璃罐。在250℉时的压力大约是15psig（磅/平方英寸），任何施加于杀菌锅的超过该15psig的压力都称之为过压。提供过压，例如25-35psig的杀菌系统可以在更高的温度下操作。--杀菌锅的作业必须适当，以确保容器经杀菌后达到商业无菌。
一般罐头食品厂对罐头作常压水煮加热杀菌处理时都采用本形式的卧式杀菌锅，本设备通过引入压缩空气可实现反压杀菌。如冷却需在锅内进行，须用水泵打入锅顶部的喷水管（或采用水循环系统）。在杀菌时，由于加热使罐头温度升高，罐头内压力会超过罐外（在锅内）的压力。因此，为了避免杀菌时玻璃瓶罐内增压而跳盖，对马口铁罐两端面凸出，必须施加反压力，特别是对需要较高杀菌温度的肉类罐头更就如此。
高温杀菌工作从开始到结束必须一次性完成，不能间断，食品也不能做反复的杀菌处理。杀菌完毕的食品用肉眼检测不出效果，菌类培养试验也需要一周时间，所以不可能对每杀菌批次的食品进行杀菌效果的检测。 基于以上特点，这就要求厂家：
1、一要做好整个食品加工链的卫生的均一性，保证每袋食品在装袋前的菌类初始量相等，这才能保证既定的杀菌公式的有效性。
2、第二就要求有性能稳定、控温精准的杀菌设备，无故障、误差极小的执行既定的杀菌公式，保证杀菌效果的标准性、统一性。
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