杀菌锅加热介质的传热效率最常用的加热介质是水和蒸汽。二者的传热系数虽然在理论，100℃时水为58.7，过热水蒸气为213，但实际操作中却没有显著差别。空气导热能力最差，它常存在于包装容器的周围，形成绝热层，严重影响杀菌效果，因此，在使用杀菌机械设备时，排气至关重要；包装容器的大小与放置方法同样内容物和同一杀菌温度下，包装容器的大小不同，其中心部分达到要求的杀菌温度和时间必然不同，小者快，大者慢。
杀菌锅放置方法主要考虑加热介质与包装容器的热交换路线畅通并均匀一致。为此，要注意包装容器在杀菌时的排列方法与紧密度。杀菌时包装容器是静止还是运动包装容器静止不动杀菌主要靠热传导升温，包装容器运动特别是回转运动，增加了对流作用，故传热速度快，操作时间短。杀菌的温度热杀菌主要靠温度作用，提高温度可以缩短杀菌时间，在同等杀菌效果前提下，温度每增加10℃，则杀菌时间缩短至原来的1/10。
高压杀菌结束后，在喷入冷水降温冷却时，要先通入压缩空气增压，压缩空气的压力应使杀菌锅内的压力略高于罐头内的压力，以防止罐头内压膨胀，最后通过喷水管放人冷却水，使水均匀地分布冷却。冷却水和蒸汽相遇将产生大量气体，这时必须打开排气阀排气。排气结束后，关闭所有排气阀门。冷却完毕，由排水管放净冷却水，然后开启锅门，推出小车，再装入下批罐头杀菌。
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