1. 各国铁路的轨道标准不一样。中国与欧洲的铁路轨道是相同的，俄罗斯的却不一样。但铁路都需要经过俄罗斯，所以火车到了俄罗斯需要换箱，俄罗斯的火车到了欧洲同样需要换箱。这无形中就增加了铁路运输的成本。
2. 铁路技术的问题。铁路技术还跟不上高速增长的国际铁路运输需求。如冷藏箱全程运输大概需要15天，正常加满一箱油能够支持冷藏到全程。运输中间遇上海关查验需要更长的时间，这就不能够保证全程冷藏。如果不能全程冷藏产品就容易坏掉。造成巨大的损失。
3. 单证问题。各国国际铁路不像国际海运一样有统一的提单。所以在中国铁路签发的提单不能在欧洲目的地直接用来提柜。
4.稳定性问题。暂时达不到每周固定的班列
5. 货运量的问题。好些火车班列从中国到欧洲铁路运输能装满货，但回程从欧洲到中国货源却没有。
6. 欧洲铁路装卸问题。国际中转火车站场，特别是欧洲的马拉舍维奇没有足够的装卸能力，导致到位站的火车不能入时卸货，经常要排队等好几天或者更久。
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