实现对生物反应系统的过程控制关键在于控制对象或控制参数的选取，而这又与处理工艺或处理目标密切相关。前已述及溶解氧是生物反应类型和过程中一个非常重要的指示参数，它能直观且比较迅速地反映出整个系统的运行状况，运行管理方便，仪器、仪表的安装及维护也较简单，这也是近十年中国新建的污水处理厂基本都实现了溶解氧现场和在线监测的原因。
二级反渗透：二级反渗透的原理与一级反渗透相同，其作用是进一步去除水中的盐分，（Ga2+，Mg2+，Fe-2 ，SO4-2，Cl-1，Na+等离子）使得水质进一步提高，经过二级反渗透后，水质电导率可以接近1MΩ.CM。经过一、二级反渗透预处理后，最后保留下来的水成为EDI的给水，而未经过反渗透膜的水（浓水）被及时排出，其比例一般为1：3，即每生产一吨的合格水，就要排掉大约3吨的浓水（中水）。
污水处理一般来说包含以下三级处理：一级处理是它通过机械处理，如格栅、沉淀或气浮，去除污水中所含的石块、砂石和脂肪、铁离子、锰离子、油脂等。二级处理是生物处理，污水中的污染物在微生物的作用下被降解和转化为污泥。三级处理是污水的深度处理，它包括营养物的去除和通过加氯、紫外辐射或臭氧技术对污水进行消毒。可能根据处理的目标和水质的不同，有的污水处理过程并不是包含上述所有过程。
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