物理方法也包括沉淀法，就是让比重较小的杂质浮于水面捞出，或是比重较大的杂质沉淀于下，进而取得。化学方法则是利用各种化学药品将水中杂质转化为对人体伤害较小的物质，或是将杂质集中，历史最久的化学处理方法应该可以算是用明矾加入水中，水中杂质集合后，体积变大，便可用过滤法，将杂质去除。
EDI的给水处理给水预处理对于EDI及其重要，组件的寿命、性能及维修量都取决于给水中的杂质含量，如果给EDI提供较好的预处理水，组件的清洗率将会降低。EDI浓水一部分循环(当给水硬度低、电导率时，可以不循环)，另外一部分可以返回到反渗透给水中，也可以回收作为他用或直接排至下水道。
污泥必须经过一定的减容、减量和稳定化无害化处理井妥善处置。污泥处理处置的成功与否对污水厂有重要的影响，必须重视。如果污泥不进行处理，污泥将不得不随处理后的出水排放，污水厂的净化效果也就会被抵消掉。所以在实际的应用过程中，污水处理过程中的污泥处理也是相当关键的。
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